進(jìn)入21世紀(jì)，隨著“云岡學(xué)”的不斷深入研究，中外學(xué)者對(duì)云岡石窟的研究異常活躍，涌現(xiàn)出一批新生代學(xué)者，成為云岡石窟研究的重要力量，發(fā)表的學(xué)術(shù)論文和專著頗多，研究的成果從不同方面探討了云岡石窟的歷史、藝術(shù)、考古和宗教等，提出的諸多新穎而獨(dú)特的見解，引起國內(nèi)、外學(xué)界的高度重視。

2000年~2009年間，是“云岡學(xué)”研究輝煌的時(shí)期。2005年7月，云岡石窟文物研究所編著《云岡百年論文選集》，將20世紀(jì)初以來100余年的云岡石窟研究成果集合成集，收集各類研究云岡石窟的論文74篇，概括地將云岡石窟百余年來的研究成果作了集中展示。最為重要的是2005年7月26～30日隨后召開的云岡國際學(xué)術(shù)研討會(huì)，成為檢閱云岡石窟研究成果的盛會(huì)。由大同市人民政府主辦、大同市文物局和云岡石窟研究院具體承辦的“2005云岡國際學(xué)術(shù)研討會(huì)”，在山西省大同市成功召開了，這次會(huì)議是我國文物界規(guī)模最大的一次國際性石窟學(xué)術(shù)研討會(huì)。大同市委、市人民政府向出席研討會(huì)的各位領(lǐng)導(dǎo)及各位專家學(xué)者表示熱烈的歡迎，國家文物局副局長張柏在開幕式上進(jìn)行了熱情而誠懇的講話，來自中國、美國、德國、日本、韓國等11個(gè)國家和港臺(tái)地區(qū)的300多位知名學(xué)者出席了這次盛會(huì)。之后結(jié)集出版的《2005年云岡國際學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集》（保護(hù)卷、研究卷），文物出版社2006年8月，分別收集論文63篇和57篇。集中體現(xiàn)了云岡石窟乃至其他石窟寺研究與保護(hù)方面的重要論文集。

這十年間，云岡石窟文物研究所撰寫的云岡石窟申報(bào)列入《世界文化遺產(chǎn)名錄》文本，2001年獲得山西省社科聯(lián)“百篇工程”一等獎(jiǎng)；同時(shí)發(fā)表與出版了大量的具有重要價(jià)值的學(xué)術(shù)報(bào)告、論文與專著。云岡石窟文物研究所《云岡石窟第3窟發(fā)掘簡(jiǎn)報(bào)》，發(fā)表于《文物》2000年6期；李憑《北魏平城時(shí)代》由社會(huì)科學(xué)文獻(xiàn)出版社出版；王恒《云岡佛經(jīng)故事》，山西人民出版社2000年；（日）八木春生《云岡石窟紋樣論》，法藏館2000年；中國石窟雕塑全集編輯委員會(huì)編《中國美術(shù)分類全集?中國石窟雕塑全集?云岡》（第三卷：李治國主編），重慶出版社2001年3月；韓府（校勘 注釋）《歷代詠云岡石窟詩萃—附歷代詠大同名勝古跡歷史風(fēng)物詩選》，中國文史出版社2002年5月；王恒《云岡佛經(jīng)故事》，山西人民出版社2002年３月；閻文儒《云岡石窟研究》，廣西師范大學(xué)出版社2003年6月；聶還貴《雕刻在石頭上的王朝》，中華書局2004年8月；王恒《云岡石窟佛教造像》，書海出版社2004年3月；（日）岡村秀典《云岡石窟?遺物篇》，日本朋友書店2006年2月；2006年張焯的《云岡石窟編年史》問世，成為目前云岡石窟的第一部通史。發(fā)表的主要論文，（日）石松日奈子《云岡中期石窟新論——沙門統(tǒng)曇曜的地位喪失和胡服供養(yǎng)人像的出現(xiàn)》（姜捷譯），《考古與文物》2004年第5期；張焯于2005年4月1日在《中國文物報(bào)》發(fā)表《〈大金西京武州山重修大石窟寺碑〉小議》一文，發(fā)現(xiàn)碑文中“多處語句抄寫竄行，使得文意混亂，難以明了”，從而對(duì)“碑文中的錯(cuò)亂語句進(jìn)行了梳理，”形成一篇“一氣呵成，環(huán)環(huán)相扣，層層深入”而文意通順的精彩篇章。根據(jù)修正后的碑文內(nèi)容，就“關(guān)于金代外護(hù)的段落”、關(guān)于“十寺”和護(hù)國寺等問題做了非常有益的說明和探討。

2010年~2011年間，“云岡學(xué)”研究以不同的角度與形式呈現(xiàn)出百家爭(zhēng)鳴的氛圍，使學(xué)術(shù)框架更完整，標(biāo)志著“云岡學(xué)”研究進(jìn)入了一個(gè)新的發(fā)展時(shí)期。2011年6月21~22日，為了進(jìn)一步加強(qiáng)云岡石窟的學(xué)術(shù)研究交流，由云岡石窟研究院主辦的“2011'中日云岡學(xué)術(shù)研討會(huì)”在云岡石窟舉行，主題為“石窟考古與石窟藝術(shù)研究”。來自日本筑波大學(xué)的八木春生一行與云岡石窟研究院專家學(xué)者等，展示了云岡這一學(xué)術(shù)研究領(lǐng)域上取得的新成果，并進(jìn)行了云岡佛教藝術(shù)表現(xiàn)方面的交流。此次中日兩國的云岡學(xué)術(shù)交流會(huì)，將對(duì)于推動(dòng)云岡石窟研究事業(yè)的蓬勃發(fā)展，具有深遠(yuǎn)的影響和意義；2011年11月3日由中共大同市委宣傳部主辦，云岡石窟研究院承辦的大同市青年女畫家王晨“云岡裝飾圖案畫展”研討會(huì)與畫展在云岡石窟舉行。與會(huì)專家學(xué)者一致認(rèn)為，該書對(duì)推動(dòng)云岡裝飾紋樣研究的發(fā)展具有積極的意義；2011年10月22日來自大陸和臺(tái)灣兩地的佛教界人士和佛教石窟寺考古的專家學(xué)者齊聚云岡石窟研究院，就《中國石窟大佛記》與云岡大佛的雕刻藝術(shù)特點(diǎn)發(fā)表了各自的意見和建議。

此外，這兩年間出版的專著如趙昆雨《云岡石窟佛教故事雕刻藝術(shù)》，江蘇美術(shù)出版社，2010年8月；李憑《拓跋春秋》，浙江文藝出版社，2010年1月；馮驥才主編《中國大同雕塑全集?云岡石窟雕刻卷》（上、下）中華書局，2010年9月；王晨繪著《云岡石窟裝飾圖案集》，天津人民美術(shù)出版社，2011年1月；張焯主編《中國石窟藝術(shù)?云岡》，江蘇美術(shù)出版社，2011年。發(fā)表的主要論文，《大同云岡石窟窟頂北魏寺廟遺址》，《中國文物報(bào)》2011年1月7日。云岡石窟研究院《云岡石窟測(cè)繪方法的新嘗試——三維激光掃描技術(shù)在石窟測(cè)繪中的應(yīng)用》（王恒執(zhí)筆），《文物》2011年第1期；《激光掃描技術(shù)為云岡石窟建“數(shù)字檔案”》，《北京檔案》2010年第2期；張焯《云岡石窟源流考略》，2011年7月8日發(fā)表于《中國文物報(bào)》文章從四個(gè)方面深入的闡述了佛教?hào)|傳的波浪式軌跡、云岡石窟開鑿的歷史因緣、東方佛教藝術(shù)的曠世絕唱、平城時(shí)代對(duì)中國佛教的重大貢獻(xiàn)。這二年來出版發(fā)表的多種從不同角度介紹云岡石窟的書籍與論文，拓展了學(xué)術(shù)思維，在宣傳和弘揚(yáng)云岡石窟文化，普及云岡石窟知識(shí)等方面，都起到積極的作用，將百年來云岡學(xué)的發(fā)展脈絡(luò)作一更新的領(lǐng)域，使其 “云岡學(xué)”研究更為完善。